Хронический запор и микробы в кишечнике: бактерии, грибы и вирусы

Хронический функциональный запор — это когда стул бывает редко или с трудом, но без явной органической причины. Учёные давно замечали, что у таких людей меняется кишечная микрофлора, но раньше смотрели в основном только на бактерии.

В этом исследовании взяли образцы кала у 53 человек с хроническим запором и 48 здоровых людей. С помощью полного метагеномного секвенирования — метода, который читает всю ДНК сразу из образца — изучили сразу три группы микробов: бактерии, грибы и вирусы.

Оказалось, что у людей с запором состав бактерий заметно сдвинут: стало меньше полезных бактерий, таких как Faecalibacterium и Roseburia, и больше потенциально вредных, например Klebsiella. Среди грибов тоже нашли изменения — некоторые условно-патогенные грибы встречались чаще. А вирусов в кишечнике у людей с запором было больше, при этом многие бактериофаги (вирусы, которые заражают бактерии) исчезли.

Учёные также построили сети взаимодействий между микробами. У людей с запором эти связи оказались плотнее, и центральную роль в них играли вирусы и бактерия Faecalibacterium prausnitzii. С помощью машинного обучения удалось по бактериям и вирусам довольно точно отличить людей с запором от здоровых, а вот грибы для этого оказались менее полезны.

Важно: это исследование показывает связь, а не причину. Неясно, что первично — запор меняет микробиоту или наоборот. И хотя результаты выглядят многообещающе, они получены на небольшой группе людей и требуют проверки на больших выборках.